华蘅芳也是在数学方面具有比较突出贡献的学者之一。他所著的《开方别术》，大大简化了中国古代的开方方法，论证了“并诸商为一商”的开方理论和方法，被李善兰誉为“空前绝后之作”。他的《积较术》中提出的一些见解，与日本从外国获得的“推差新法”相似，但成书却早十余年。另外，在其他一些研究方面，华蘅芳也取得了一定成绩。这表明，即使没有西方微积分的传入，中国数学家也能通过自己的努力，使传统数学逐步由初等数学向高等数学转变。尽管中国数学家在数学研究中取得了不少成绩，但是中国的数学研究毕竟因为长期的封建社会的停滞等原因，大大落后于西方，因此，近代中国在数学领域仍然是以学习西方数学、传播西方数学知识为其进步的主要内容。
1840年，通过在华传教士和中国学者的翻译，继明末清初耶稣会士输入一些近代数学成果之后，在中国历史上又出现了一个西学传播的高潮。中国数学家和其他学者不仅在翻译介绍西方数学成果方面付出大量劳动，为西方近代数学知识的传播做出巨大贡献，而且在此过程中又对近代数学的某些领域进行发展和改进。李善兰通过翻译西方数学著作，掌握了不少西方的近代数学，也了解了西方的数学思想，中西数学在他的后期研究工作中得到了会通。1860年后，他的数学研究的方向转向圆锥曲线、级数和数论方面，先后著有《椭圆正术解》2卷、《椭圆新术》1卷、《椭圆拾遗》3卷以及椭圆曲线在弹道学方面的应用《火器真诀》1卷、《尖锥变法解》1卷、《天问或算》1卷、《考数根四法》1卷等著作，其中很多内容属于中西会通的精心之作。例如，《尖锥变法解》就是李善兰掌握了微积分方法与自己早期创立的尖锥术在对数上作比较写出来的。华蘅芳的数学代表作《学算笔谈》以通俗简明的语言和形象具体的例题，介绍了西方近代数学基本知识和代表当时最新成果的微积分数理及其解法，还介绍了由浅入深、循序渐进的学习数学的方法。这些都反映了中国数学家在学习、介绍、研究近代数学方面的重要活动与成绩。到近代后期，中国教育界则进一步将近代数学引入学校教育，一些西方数学著作被改编为教材，使近代数学教育在相当大的程度改变了传统的自学与师友相传授的狭隘传播方式。