关于心性本净与否的问题，有部持与大众部相反的观点。根据大众部的思想，众生心性虽处于杂染之中，但其是本来清净的。也就是说，大众部对心之本性持一种理想主义的态度，肯定众生解脱觉悟的可能性。有部则认为，这样一种理想主义的心性观与心理现象的事实不符合。善与恶都只是心理作用而已，与心王相应，若离心王则无心之作用。离开心王没有所谓本性净与否的问题，因而否证了心性本净思想。有部关于心性的思想充分体现了其以作用论心的思想特点，在此意义上，有部坚持了佛陀原始教说中的无我观，严防以心性问题的面目复活有我论。
以上我们讨论了一切有部的心理思想，从中我们可以大致找出一切有部教育思想的基本思路。以作用心与本性心相对，是一切有部思想的一个基本特色。大众部的心性本净思想中实际上已经蕴含了后来在大乘佛教思想中得到发挥的自性清净心思想。作为如来藏的自性清净心就是众生之佛性，即成佛之内在的可能性。只是这样一种可能性无论是在大众部还是在大乘思想中，都只具有境界一边的所知的意义。但是，这种思想存在着误把心性作为一种心体或心理作用的可能。也就是说，本净之心原本已非缘起之心、作用之心，而是一种性理，但以心性称之，就有可能使人误以为心性亦是一种心。这种误解在中国佛教思想中就有所体现。一切有部严格区分心性与心相的区别，即进一步明确了心与性之间的不同，以心为能知，以性为所知；以作用论心，以理体论性。有部这样一种思想倾向继承了上座部注重现实的态度。基于这样一种思想态度，有部就不是以高标理想来树立教育目标，而是多从实践的要求出发，以促进善心的增进为修行的具体德目，对最终的果位与不同阶段之修行所证也都抱一种现实的态度。表现于教育上，以随眠为心所，且为缠所摄的思想，就与大众部之以随眠非心所，而且与缠性质不同的论调截然不同。把随眠视作为缠所摄，就是把随眠这样一种认识上的障蔽看作与情意方面的烦恼一样是一种心理作用，是可以通过心理作用过程而克服的。这样就把教育的针对性放在了一个现实的基础上，因而有助于把教育视为一种实际的理性化的教学过程，而教育的目标也是可以通过理性手段达到的。与这样一种思想相应，具体教学就自然会讲求教育方法，肯定教育的必要性，着重教育手段的改进。这些都是与大众部高标理想而忽视现实手段的提高和改进的不同之处。