万历皇帝亲自下了两个结论：一，关于要不要革海瑞的职。他说，海瑞的言论虽然“有乖政体”，“词多迂戆”，但作为老同志，还是可以原谅的。二，关于要不要调离现任岗位。他同意吏部的建议，海瑞节操是好的，但做事方法不对头，不能得到广大官员的拥护，不宜出任要职，还是做回都御史这样的虚职比较合适。万历皇帝的原话是：“虽当局任事，恐非所长，而用以镇雅俗、励颓风，未为无补。”
如今史学界最为流行的评价海瑞的观点，其实都是从万历皇帝这里来的：海瑞迂腐可笑，是清官但不是能臣，做事水平有限，给他加一个道德模范的荣誉供着就得了。
然而，海瑞真的只是中国版的堂·吉诃德，勇气可嘉而特别可笑吗？有没有可能是因为，他触动了太多人的利益而被刻意抹黑？
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海瑞的一生经历过三起三落。
第一“起”，是从福建的县学教谕直接晋升为浙江淳安县令。也就是说，花了4年时间，从不入流的小官员，成了七品官。虽然那一年海瑞已经45岁，鬓角发白，但对他来说，这个进步还是相当快的。