不知不觉，潘多拉入侵联邦中央政府大楼的事件已经过去了一个月。
核心地区的一切都恢复了正轨，潘多拉最近也没有干扰联邦政府的行动了。
联邦中央政府也不清楚潘多拉的去向，只能私底下默认潘多拉被宁夜执政官打败，不敢继续对联邦中央政府出手。
战斗的中心——联邦中央政府大楼遭到了不可弥补的损失。潘多拉把高层领导办公室的资料都转移走，让一些没有保存在数据库的资料永远地遗失了。
不过根据后续的追踪，那些资料被潘多拉移动到了郊区外的十三号贫民窟。那片充满污秽和尸骨的土地让联邦政府放弃了回收资料的打算。
面对潘多拉的两大主力，警卫部和巡逻队都得到了联邦中央政府一定程度的褒奖，拿到荣誉顺利地回到了基地。
搜救队从破损的联邦中央政府大楼中，从第十五层中找到了昏迷不醒的魂主元，也算是给联邦政府之魂总部的研究员一个交代。